En 1976, à l’occasion de travaux de pavage réalisés dans la Cour d’Honneur du Palais de Justice de Rouen, un Monument juif est découvert. Daté de la fin du XI^e-début XII^e siècle, il est considéré comme le plus ancien édifice hébraïque connu en France et comme l’unique monument juif d’époque médiévale.

À la suite du classement du monument (1977), de la réalisation de la crypte et de la couverture du monument par une dalle de béton (1978), des travaux sont réalisés sous la direction de l’architecte en chef des monuments historiques Georges Duval et l’ouverture au public de la crypte est rapidement organisée (1980).

À la suite de la réalisation d’études de diagnostic et de mesures climatiques, la crypte qui abrite le Monument juif a fait l’objet de travaux d’isolation et de création d’un système de ventilation sophistiqué, permettant de maintenir un confinement en l’absence du public, mais aussi de créer une atmosphère saine lors de la présence du public. Une scénographie a permis la mise en valeur du monument tout en apportant un contenu pédagogique vis-à-vis des publics. Un ascenseur permet enfin l’accès des visiteurs en situation de handicap à la crypte.